El caso de las células STAP: Tercer evento aclaratorio

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A principio de esta semana tuvo lugar el tercer evento aclaratorio del caso de las células STAP («El caso de las células STAP: mientras esperamos …«). El Dr. Teruhiko Wakayama, coautor de los polémicos artículos publicados en la revista Nature sobre un nuevo método para crear células madre, células Stimulus-Triggered Acquisition of Pluripotency o STAP (1,2) y encargado de la creación de ratones «quimera» que tenían tanto células del embrión de acogida como células STAP, a raiz de las preguntas surgidas tras la publicación del método analizó genéticamente las líneas de células madre que Haruko Obokata (principal autora de los artículos) produjo mediante el método descrito en los artículos y que eran pruebas previas a la publicación.

Esas líneas de células STAP provenian de la cepa de ratón conocida como 129 y que el propio Wakayama pasó a Obokata para que provase el método en otras cepas diferentes a la utilizadas en los experimentos publicados, la cepa híbrida 129B6F1. El éxito con la línea 129 fue mencionado de pasada en la sección de métodos en el artículo principal, pero los datos de la células STAP derivados de la línea 129 no fueron descritos.Nueva discrepancia en las células STAP

Según los análisis realizados, las líneas celulares STAP analizadas eran genéticamente diferentes a la cepa de ratón 129. Eran son de dos cepas: B6 y 129B6F1. Lo que sembró la duda de una posible contaminación («Nueva discrepancia en las células STAP«). Para verificarlo, wakayama las lineas de las supuestas células STAP al National Institute of Radiological Sciences (NIRS) en Chiba, al este de Tokyo para que también las analizara («El caso de las células STAP: mientras esperamos …«).

El lunes se presentaron los resultados, verificando los análisis de Wakayama, sugiriendo así que las células STAP no sean más que más que las células madre embrionarias normales, posiblemente producto de muestras conmutadas.

El NIRS se fijó en los lugares de los genomas de los ratones donde la proteína fluorescente verde (green fluorescent protein, GFP), proteían que utilizaron los investigadores como marcador de expresión de ciertos genes, se había insertado. En los ratones de Wakayama dio a Obokata, el gen GFP estaba en el cromosoma 18a. Sin embargo en las supuestas células STAP, estaba en el cromosoma 15. Esto sugiere que probablemente utilizaron ratones diferentes.

«En mi laboratorio, no hay ni ratones, ni las células madre embrionarias con las buenas prácticas agrarias en el cromosoma 15,». «No podemos decir con certeza que las células del STAP nunca existieron. Si bien la gestión de los ratones experimentales es muy estricta en el BDC, siempre es posible que Obokata trajese ratones recién nacidos de algún lugar «, dijo a Wakayama a la revista Nature.

Otras pruebas realizadas por RIKEN CDB y publicadas al mismo tiempo ponen aún más en tela de juicio el origen de las células STAP. El CDB miró el lugar de inserción de GFP y los antecedentes genéticos de otras 6 lineas celulares STAP que Oboka había guardado en su laboratorio.

«Los resultados están de acuerdo con los resultados de los análisis de las muestras realizadas por el Prof. Wakayama,» escribió el director CDB, Masatoshi Takeichi en la web del centro.

Takeichi también dice que las células con GFP en el cromosoma 18a son «de origen desconocido» y que el CDB está investigando la fuente de estas células.

Obokata dice a través de su abogado Hideo Miki, que es imposible.

«Ella no cree que podría haber sucedido, no a propósito o por error», dice Miki.

Fuente: Artículo de Nature

 

El caso de las células STAP: mientras esperamos …

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Hoy hace un poco más de una semana que Haruko Obokata apareció, por primera vez en mucho tiempo, en una rueda de prensa para pedir disculpa de sus errores y defender sus resultados  («Conferencia de Haruko Obokata»), Pero sus palabras no aclararon toda la controversia surgida a raiz de la publicación de los artículos de Nature (1,2) sobre unas nuevas células madre, las células STAP (Stimulus-Triggered Acquisition of Pluripotency).

Hitoshi NiwaAhora sólo nos cabe esperar que en los próximos meses los resultados de los tres eventos claves nos aclaren todo este lío:

  1. La replicación del método STAP basándose en el protoco de Obokata por parte de Hitoshi Niwa, co-autor de los artículos y que también trabaja en el RIKEN Center for Developmental Biology (CDB). Se espera que la replicación tome un año pero a finales del mes de Julio se dará un informe preliminar («Novedades en el caso de las células STAP»).
  2. La respuesta del centro RIKEN al recurso de apelación presentado por Obokata el pasado 8 de Abril tras el veredicto del  centro dictaminado el 1 de Abril («Novedades en el caso de las células STAP»«Conferencia de Haruko Obokata»). El centro de investigación concluyó, después de la investigación de los problemas surgidos después de la publicación de método STAP, que el trabajo fue parcialmente falsificado y que su principal autora, Haruko Obokata, era culpable de mala conducta al encontrar pruebas de falsificación y fabricación de datos ( “Informe provisional sobre el caso de las células STAP”). El centro tiene 50 días para responder.
  3. Teruhiko WakayamaTeruhiko Wakayama, de la Universidad de Yamanashi (Japón) y uno de los co-autores de los artículos (“Continua la polémica en las células STAP: ¿habrá polémica?”  ; Nueva discrepancia en las células STAP” ), ha enviado 8 lineas de las supuestas células STAP a un centro anónimo para determinar si podrían haber sido producidas por contaminación en lugar del estrés. Debido a la utilización de varios ratones se espera que las lineas sean diferentes genéticamente y que correspondan a los animales de orígen. Pero si las lineas son identicas genéticamente, sugeriría que los resultados se produjeron a través de contaminación.

Mientras esperamos los resultados, este miércoles Yoshiki Sasai, invetigador del centro RIKEN y subdirector del RIKEN CDB convocó una rueda de prensa donde respaldó la existencia de las células STAP.

«Estoy seguro de que lo que se llaman células STAP son células que han sido desconocidos hasta ahora«

Sasai, mentor de Haruko Obokata y tamnién co-autor de los artículos, se disculpó por haber causado toda esta confusión. Dijo que se unió al proyecto en la etapa final, finales de Diciembre del 2012 y sólo cooperó en la reescritura. Sólo asesoró y lamentó su fracaso al no notar los problemas. La mayoría de los experimentos de las células STAP se habían completado antes de su unión. No tuvo la oportunidad de comprobar los datos puros y las notas de la investigación. Dijo que pensaba que los datos ya habían sido verificados por Teruhiko Wakayama.

Yoshiki Sasai, subdirector del RIKEN CDB, se inclina al final de la conferencia de prensa en Tokio el 16 miércoles.

Yoshiki Sasai, subdirector del RIKEN CDB, se inclina al final de la conferencia de prensa en Tokio el miércoles 16.

Pero sugerió fuertemente la existencia de esta células madre:

Los tres fenómenos que se observaron en los experimentos las apoyan

  • La células comenzaron a brillar de color verde. Según Sasai, este fenómeno es un marcador para un gen que permite pluripotencia, la capacidad de una célula de convertirse en otros tipos células . Este fenómeno fue grabado en vídeo a través de un microscopio (“Revolución en la medicina regenerativa”).
  • Una forma única de los que se cree que son células STAP. Son diferentes de las células sanguíneas originales que se pusieron bajo condiciones de estrés.

    «Estas células son más pequeñas que las células madre embrionarias y hay diferencias significativas en la forma en que los genes ‘de trabajo y su capacidad de proliferación. Así que no es posible se han mezclado para arriba con células madre embrionarias «.

  • La creación del ratón quimera.

Os aconsejo que os leáis el post del 16 de Abril de Paul Knoepfler comentando esta conferencia (aquí).

Fuentes:

Nueva discrepancia en las células STAP

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Nueva discrepancia en las células STAP

Esta semana ha vuelto a salir una  noticias de una nueva discrepancia en el método descrito por Haruko Obokata et al. en dos artículos de Nature (1,2). Para los que no conozcan el tema os haré un muy breve resumen: Haruko Obokata et al  publicó a finales de enero dos artículos que decribían una forma sencilla de crear células madre  por inmersión en ácido de células maduras o por presión física a estas. Pero en seguida surgieron denuncias en blogs por el uso de imágenes duplicadas y pasajes plagiados que desencadenaron una investigación por parte del Centro RIKEN del Developmental Biology (CDB) en Kobe, Japón, donde la Dra Obokata trabaja. Pero solo se está investigando eso, sino también trabajos anteriores y la Tesis Doctoral de Obokata. Toda una revolución en Japón. A eso también se le deben sumar, los intentos infructuosos de otros investigadores por reproducir el método y la petición de una retracción por parte de uno de los coautores, el Dr Teruhiko Wakayama. En los post: “Revolución en la medicina regenerativa”; “Controversia: Las células STAP bajo sospecha” y«Continua la polémica en las células STAP: ¿habrá polémica?»se explica todo esto más detalladamente.

La nueva discrepancia surge de uno análisis genético preliminar realizado por Wakayama en su propio laboratorio a raiz de todas las preguntas surgidas tras la publicación del método. Wakayama realizó este análisis a unas líneas celulares de células madre que Obokata produjo mediante el método descrito en los artículos y que eran pruebas previas a la publicación.

Estas lineas de células STAP provenian de la cepa de ratón conocida como 129 y que el propio Wakayama pasó a Obokata para que provase el método en otras cepas diferentes a la utilizadas en los experimentos publicados, la cepa híbrida 129B6F1. El éxito con la línea 129 fue mencionado de pasada en la sección de métodos en el artículo principal, pero los datos de la células STAP derivados de la línea 129 no fueron descritos.

Según los análisis realizados, las líneas celulares STAP analizadas son genéticamente diferentes a la cepa de ratón 129 y que son de dos cepas: B6 y 129B6F1.

Estos resultados no pone en tela de jucio los artículos de Nature, añade Wakayama.

La contaminación de las líneas de células madre puede pasar. «Pero la posibilidad de tener dos líneas de células STAP contaminados por diferentes líneas troncales embrionarias es muy, muy pequeño», dice Hiromitsu Nakauchi, investigador de células madre de la Universidad de Tokio, que no ha visto el análisis de Wakayama. Si  se verificasen los análisis, «Algo está gravemente equivocado» añade Nakauchi

Fuentes:

 

Continua la polémica en las células STAP: ¿habrá retracción?

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La forma sencilla para crear células madre por inmersión en ácido de células maduras o por presión física descritas por Haruko Obokata en dos artículos de Nature (1,2) y que fue motivo de dos mis post («Revolución en la medicina regenerativa»;«Controversia: Las células STAP bajo sospecha») continua siendo imposible de replicar. En el último post, ya comentaba la dificultat que estaban teniendo el resto de la comunidad científica que estaba intentando reproducir el método sin éxito.

embryo made from STAP cells

Qi-Long Ying, un biólogo de células madre en la Universidad de Southern California Keck School of Medicine de Los Angeles, lo he intentado dos veces y Paul Knoepfler, un investigador de células madre de la Universidad de California, Davis ha creado una página en su blog para intercambiar experiencias entre las personas que hayan intentando válidar el método de las células madre STAP y quieran publicar sus hallazgos: STAP NEW DATA . Diez de los presuntos intentos anunciados en el blog han fracasado.

♣ También en el último post sobre este tema, comenté que los autores publicarían protocolo detallado pronto. Pero como la preparación, la presentació y la publicación de este requiere tiempo, el pasado 5 de Marzo publicaron una serie de consejos técnicos para el cultivo de la conversión de la células STAP y experimentos relacionados en el  Protocol Exchange con la esperanza de que estos consejos puedan responder a muchas de las preguntas más frecuentes sobre los detalles experimentales que reciben de los investigadores que estan intentando reproduir en sus respectivos laboratorios.

A pesar de su aparente simplicidad, el procedimiento requiere un cuidado especial en las condiciones de manipulación de las células y del cultivo, así como en la elección de la población de células de partida. La cantidad de estrés subletal suministrado a las células es esencial para el proceso de inducción de las células STAP pero también hay otros factores que también influyen como la preparación y manipulación de las células antes y depués de la exposición al estrés. Estos se deben realizar con sumo cuidado ya que un daño adicional podría alterar el nivel de estrés, causando la muerte célular excesiva o insuficiente activación. Estos consejos y más los podéis ver detalladamente clicando aquí.

Tanto la revista Nature como el Centro RIKEN continúan investigando toda esta polémica. Ayer el Wall Street Journal publicó un artículo donde se comentaba que un portavoz del Centro RIKEN había afirmado que el centro estaba considerando una retracción y que los autores de los artículos estaban discutiendo qué hacer. También dicen que Teruhiko Wakayama de la Universidad de Yamanashi (Japón) , coautor del estudio original, ha pedido a la autora principal, Haruko Obokata, retraer los estudios.

El Dr. Wakayama (en la imagen) fue el encargado de la creación de ratones «quimera» que tenían tanto células del embrión de acogida como células STAP. Ahora dice que las células STAP que recibió de la doctora Obokata pueden no haber sido lo que él pensaba.

«Yo mismo no sé lo que he usado en mis experimentos» dijo Wakayama por correo electrónico al Wall Street Journal. Añadió que él entregaría a las células en su poder a un tercero para su investigación.

Qi-Long Ying comenta en un artículo de ScienceNews:

«Creo que todavía es demasiado pronto para llamar una retracción de los artículos». «Nature debe invitar al Dra. Haruko Obokata replicar sus propios resultados en un laboratorio independiente y de prestigio elegido por Nature. Esta es la forma más eficiente para pobar si la historia de las STAP es verdad o no»

Otros investigadores dicen que la responsabilidad recae en los autores para demostrar la validez de la obra. Pero con la disensión dentro del equipo de investigación original, «No va a ser un camino fácil a la claridad», dice Knoepfler.

La revista Nature recoge toda la actualidad sobre el caso de las Células STAP en el resumen semanal del 7-13 de Marzo: «Retraction call» y en un post en el Nature News Blog

Fuentes: